ECサイトの運営代行とは？基本的なサービス内容から費用、選び方、依頼する際の注意点まで徹底解説！

本記事では、累計1,000社以上の支援実績があり、年間広告運用費が10億円を超える弊社（プロテーナム）がECサイトの運営代行について、サービス内容から費用、依頼する際の注意点に至るまで徹底解説します！

本記事は、「ECの人員が足りない」「ECの売り上げが伸びない」などの理由からECの運営代行を検討されている事業者様を対象としています。

本記事を読むことで、ECサイトの運営代行とは何か、費用はどのくらいか、どのように選べばよいかなどの詳細な部分が明確になります。

ECサイト運営代行サービスとは？

EC事業の拡大を目指す企業にとって、外部パートナーの活用は有力な選択肢の一つです。しかし、言葉の定義が曖昧なまま導入するとミスマッチが起こります。ここでは、単なる作業代行とは一線を画す、現代の「運営代行」の本質について解説します。

EC事業に関わる「戦略」から「実行」をプロが代行するサービス

ECサイト運営代行とは、自社のECサイト（自社サイト、楽天、Amazonなど）の運営に必要な業務を、外部の専門企業に委託することを指します。

一般的な「人材派遣」や「クラウドソーシング」とは異なり、指示された作業をこなすだけでなく、「どうすれば売上が上がるか（KGI/KPIの達成）」というコンサルティング要素を含んでいるのが大きな特徴です。単なる「手」の提供ではなく、「脳」と「手」の両方を提供するサービスと言えます。

従来の運営代行は「単純作業の代行」が主流でしたが、EC市場の成熟に伴い、現在は以下のように役割が高度化しています。

• 従来型： 商品登録、バナー画像の切り抜き、受注処理、在庫連動などの定型業務のみを行う、作業代行に近いイメージ。
• 現在： アクセス解析に基づくUI改善、広告運用の最適化、CRM（顧客関係管理）によるLTV向上施策など、売上責任（PL責任）を共有するEC事業を伴走するパートナー。

つまり、現代におけるEC運営代行とは、「外部に優秀なEC専門のWeb担当者とマーケティングチームを、必要な期間だけ雇う」ことと同義と言えます。

【比較：自社採用/派遣/運営代行の違い】

項目	自社採用（正社員）	人材派遣	EC運営代行
専門性	個人差が大きい	一般的な事務スキル	EC特化の高度な専門性
教育コスト	非常に高い	低い	不要（即戦力）
コスト構造	固定費（社会保険含む）	時給・固定費	変動費化が可能
マネジメント	必要（育成・評価）	必要（業務指示）	不要（成果管理のみ）

ECサイトの運営代行企業の提供内容とは？

「運営代行」と一口に言っても、その守備範囲は業者によって大きく異なります。サイト構築から物流連携（フルフィルメント）まで、一般的に提供されるサービス領域を整理しました。自社が補強すべき領域はどこか、照らし合わせながらご確認ください。

【関連動画：ProteinumのEC運用代行サービスについて】

戦略立案、サイト制作、集客、フルフィルメントまで多岐にわたる業務を提供

運営代行企業が提供する業務範囲は非常に幅広く、大きく分けて以下の4つの領域があります。これらをワンストップで依頼することも、特定の領域のみ（例：広告運用のみ）スポットで依頼することも可能です。

一つ注意すべきなのが、完全に丸投げをして自社ではECにコミットしないということだけは絶対に避けるべきです。
多くの企業が「面倒な業務すべて」を丸投げしようとしますが、「自社の強み（商品開発力・ブランドストーリー）」以外を任せるのが成功の秘訣です。コアバリューまで外部化すると、ブランドの独自性が失われるリスクがあります。

【主な提供業務一覧】

1. サイト構築・更新・クリエイティブ制作
ユーザーの購買意欲（CVR）を左右する店舗の「見た目」と「使いやすさ」を整備します。

• ECサイトの立ち上げ、カートシステムの選定、リニューアル
• 商品ページ（LP）の構成作成、撮影ディレクション、採寸・原稿作成
• シーズンバナー制作、特集ページ作成
• UI/UX改善（導線設計、カゴ落ち対策）

2. デジタルマーケティング・集客
適切なターゲット層をサイトへ誘導し、認知拡大と獲得を行います。

• Web広告運用（Googleショッピング広告、リスティング、Meta広告など）
• SEO対策（検索キーワード選定、コンテンツマーケティング）
• CRM施策（メルマガ配信、LINE公式アカウント運用、ステップメール構築）
• SNS運用代行（Instagram運用、インフルエンサー施策）

3. バックオフィス・フルフィルメント
顧客満足度（CS）に直結する、注文後の対応業務を担います。

• 受注処理（サンクスメール送信、入金確認）
• 在庫管理・棚卸し
• カスタマーサポート（電話・メール・チャット対応、クレーム対応）
• 倉庫（物流）連携、配送伝票の発行

4. コンサルティング・分析
数値を可視化し、次なる打ち手を策定します。

• Google Analytics等を用いたアクセス解析、月次レポート作成
• 定例ミーティングでの進捗報告・改善提案
• 競合他社の調査、年間販売スケジュールの立案

ECサイトの運営代行の4つのメリットとは？

EC運営代行を活用することは、単なる「人手不足の解消」ではありません。経営的な視点で見ると、事業成長のスピードを加速させ、かつ固定費を変動費化させるための戦略的レバーとなります。

主なメリットは以下の4点に集約されます。

【EC運営代行導入の4つのメリット】

メリット	具体的な効果	経営へのインパクト
コスト削減	専門職を複数名採用するより、トータルコストが安い。	固定費の圧縮 人件費・採用費の大幅削減。
即効性	プロの知見に基づき、初月から最適な施策が打てる。	垂直立ち上げ 育成期間を短縮し、機会損失を防ぐ。
リソース集中	ルーチン業務から解放され、社員が本来の業務に没頭できる。	付加価値の向上 商品開発やブランディングに専念。
客観的分析	社内の「思い込み」を排除し、データに基づいた改善ができる。	確実性の高い投資 「感覚」ではなく「数値」での経営。

以下、それぞれの詳細を解説します。

自社で専門チームを組成するよりも、トータルコストで安価に

ECサイトの売上を最大化するためには、「Webマーケター」「Webデザイナー」「ECコンサルタント」「運営ディレクター」など、多岐にわたる専門スキルが必要です。 これらを全て自社採用（正社員）で賄おうとすると、給与に加え、採用費・社会保険料・設備費などの莫大な固定費がかかります。

一方、運営代行であれば、「1人の正社員を雇う程度の月額費用」で、これら全てのスペシャリストチームの機能を利用できます。

• 自社でチーム構築の場合： 月額 約150〜200万円（3〜4名分の人件費＋採用コスト）
• 運営代行を利用の場合： 月額 約30〜50万円（代行費用）

結果として、同じスキルセットを揃える場合、外注の方が圧倒的にコストパフォーマンスが高いケースが大半です。

EC人材の工数や人件費に関しては以下の記事でも解説しているので、是非参考にしてみてください。

楽天市場の店舗運営に必要な工数を徹底解説！作業内容から必要な人員数まで具体例を用いて紹介！

プロのノウハウによる「即効性」で、立ち上げ期間を短縮

EC業界は変化のスピードが極めて速く、SEOのアルゴリズム変更や広告運用のトレンドは数ヶ月単位で変わります。社内で未経験者を育成する場合、戦力化するまでに少なくとも半年〜1年の期間を要し、その間の「売上が上がらない期間」が機会損失となります。

運営代行を利用すれば、契約したその日から「経験豊富なプロフェッショナルチーム」が稼働するため、初月から効果的な施策を実行し、売上を作るまでのリードタイムを劇的に短縮できます。

煩雑な庶務を外部化し、社員を「コア業務」に集中可能に

EC運営には、売上には直結するものの作業自体は定型的な「ノンコア業務（受注処理、在庫連動、バナーのリサイズなど）」が膨大に存在します。これらに社員のリソースが奪われると、企業としての競争力が低下します。

運営代行によってこれらの業務を切り離すことで、社内の人材は「その会社の人間にしかできないコア業務」にリソースを全集中させることができます。

• コア業務（社内でやるべき）： 新商品の企画、ブランドストーリーの構築、実店舗との連携企画
• ノンコア業務（任せるべき）： ページ更新、画像加工、受注対応、広告設定

客観的データに基づいた改善による売上向上

社内だけで運営を続けていると、どうしても「自社の商品は良いはずだ」というプロダクトアウトの思考や、「昔からこうやってきた」という慣習に囚われがちです。

代行会社は、数多くの他社事例や業界のベンチマークデータを持っています。そのため、「業界平均と比較してCVR（転換率）が低い」「競合他社に比べて画像の訴求力が弱い」といった課題を、感情論抜きにして数値データとして指摘・改善することができます。

ECサイトの運営代行の3つのデメリットとは？

メリットが強力である一方で、外部委託ならではの構造的なデメリットも存在します。導入後に後悔しないよう、あらかじめリスクと対策をセットで理解しておくことが重要です。

【EC運営代行の３つのデメリットと対策一覧表】

デメリット	具体的なリスク	推奨される対策
費用対効果	成果が出るまで時間がかかり、コストが見合わない期間が生じる。	外注費を上回る「粗利増加額」のシミュレーションと期間設定。
ノウハウ空洞化	契約終了後、社内に何も残らず自走できなくなる。	定例会でのレポート共有や、マニュアル納品を契約に含める。
商材理解のズレ	商品の魅力やブランドの想いが顧客に伝わらない。	商品研修を実施し、ブランドコンセプトを深く共有する。

費用対効果が見合わず、コストが先行してしまうリスク

「代行会社に頼めばすぐに売上が倍になる」という過度な期待は禁物です。特にSEO対策やコンテンツマーケティングなどの施策は、効果が出るまでに数ヶ月を要します。 そのため、成果が出るまでの期間は「支払うコスト」の方が大きくなり、一時的にキャッシュフローや利益率が悪化する可能性があります。

• 対策： 代行費用を「コスト」ではなく「投資」と捉え、ROI（投資対効果）のシミュレーションを事前に行うことが不可欠です。 「いつまでに、いくらの売上増を作ればペイするのか」という損益分岐点を明確にし、代行会社と共有しながら進捗を管理する必要があります。

丸投げによる「ブラックボックス化」で、社内にノウハウが蓄積されない

最も避けるべき失敗パターンが、「面倒だから全て任せる」という丸投げです。プロセスを共有せずに結果だけを求めていると、契約終了時や担当者変更時に「何がどうなっているのか誰も分からない」という状態に陥ります。

• 対策：契約段階で「ノウハウの共有（内製化支援）」を条件に盛り込むことを推奨します。 具体的には、ブラックボックス化させないために、以下の取り組みを行います。
  • 月次の詳細レポートをもらう
  • 施策の目的/意図を定例会で聞く
  • 業務マニュアルを作成してもらう

商材への「熱量」や「理解度」にギャップが生まれる可能性

代行会社の担当者は「売るプロ」ですが、貴社の「商品のプロ」ではありません。
特に、こだわりが強い商品やニッチな商材の場合、表面的なスペック情報だけでは魅力が伝わらず、顧客対応や商品紹介文にズレが生じることがあります。

• 対策：「外部の人だから分からない」と諦めるのではなく、「パートナーをファンにする」姿勢が必要です。
  • 新商品のサンプルを実際に使用してもらう
  • 開発秘話やブランド創業のストーリーを共有する
  • CS対応のガイドライン（トーン＆マナー）を一緒に作成する

ECサイトの運営代行のタイプとは？

運営代行会社を選定する際、最初に確認すべきは「どのプラットフォームに強いか」という専門性です。ECの売上を作るロジックは、出店場所によって全く異なるため、代行会社も大きく「モール特化型」と「自社サイト特化型」「両対応型（ハイブリッド）」の3つに分類されます。

具体的に「どんな企業があるか分からない」という方も多いかと思います。
以下記事では、具体的なおすすめのEC運営代行企業について、まとめていますので是参照ください。

ネットショップ運営代行とは？サービス内容から料金相場、選定ポイントまで徹底解説！

では、それぞれのタイプの詳細を確認していきます。

1. モールに強い運営代行（楽天・Amazon・Yahoo!ショッピング等）

楽天市場やAmazonなどのショッピングモールでの売上最大化を得意とするタイプです。モール特有の「ランキングアルゴリズム」や「イベント対策（スーパーセール等）」に精通しています。

• 特徴：検索順位対策（モール内SEO）、RPP広告運用、イベント時のポイント設定など、モール仕様に特化した運用が得意。
• 向いている企業：既にモールに出店しているが売上が伸び悩んでいる企業、モール内でのシェアを取りたい企業。

2. 自社ECに強い運営代行（Shopify・MakeShop・futureshop等）

独自ドメインの公式サイト（本店）の構築・運用を得意とするタイプです。集客を自力で行う必要があるため、Web広告やCRM施策に長けています。

• 特徴：ブランドの世界観構築、自由度の高いUI/UX改善、SNSマーケティング、顧客データ分析に基づいたリピート施策が得意。
• 向いている企業：D2Cブランド、利益率を高めたい企業、顧客リスト（資産）を自社に蓄積したい企業。

3. モール・自社EC両方に強い運営代行（ハイブリッド型）

モールと自社サイトの両方のノウハウを持ち、多店舗展開の支援を得意とするタイプです。「モールで認知を広げ、自社サイトでリピートさせる」といったクロスチャネル戦略が可能です。

• 特徴：在庫一元管理システムの導入支援や、チャネルごとの役割分担（ポートフォリオ）設計が得意。
• 向いている企業：複数店舗を運営している企業、モール依存から脱却し自社サイトも育てたい企業。

ECサイト運営代行の費用と主要な料金体系とは？

EC運営代行の導入検討において、最も検討すべき部分が「費用」です。
運営代行費用は、依頼する業務範囲（作業量）や売上規模によって変動しますが、契約形態は大きく分けて「固定報酬型」「成果報酬型」「複合型」の3つに分類されます。それぞれの特性と相場感を把握し、自社の予算計画に最適なプランを選択することが重要です。

料金体系ごとの費用相場と業務内容

以下が料金体系ごとの費用相場と業務内容です。
各料金体系において、提供される業務の質や範囲は異なります。以下の比較表を参考に、自社のフェーズ（立ち上げ期・成長期・安定期）と照らし合わせて検討してください。

【料金体系別の費用・業務内容・適合企業比較表】

料金体系	費用相場（月額）	メリット	デメリット	向いている企業
固定報酬型	10万円〜50万円	毎月のコストが一定で予算管理が容易。	売上が低い月でも固定費が発生する。	業務の一部（制作、更新、CS等）を切り出して依頼したい企業
成果報酬型	売上の10%〜20% （別途初期費用）	売上が立つまでランニングコストを抑えられる。	売上が伸びると支払額が高額になる。	新規立ち上げ期の企業 初期リスクを最小限に抑えたい企業
複合型 （固定＋成果）	固定5万〜 + 売上の5%〜	固定費で稼働を保証し、成果報酬で代行会社の高いパフォーマンスも期待できる。	固定費と成果報酬の両方が発生する。	月商100万円以上で 更なる拡大を目指す成長期の企業

失敗しないEC運営代行会社の選び方と導入手順

運営代行会社選びにおける失敗の多くは、「とりあえず全て任せたい」という丸投げの姿勢や、契約内容の確認不足から生じます。 パートナーシップを成功させ、確実に費用対効果を高めるためには、以下の5つのステップを経て選定を行うことが不可欠です。

項目	具体的なアクション	確認ポイント
業務の切り分け （コアorノンコア）	社内業務を棚卸し、「自社でやるべきこと」と「任せるべきこと」を明確に区分する。	・依頼したい業務範囲が具体的に言語化されているか？ ・「丸投げ」によるミスマッチのリスクを排除できているか？
RFP（提案依頼書） による比較	必ず3社以上に問い合わせを行い、口頭ベースではなく「RFP（要件定義書）」を提示して具体的な提案を受ける。	・各社の「提案力」「戦略眼」が、同一条件での比較か？ ・安さだけでなく、提案内容の質に納得感があるか？
実績の 「再現性」確認	実績数だけでなく、「自社とと類似性」や「成長フェーズ」での成功事例をヒアリングする。	・成功要因が論理的に説明されているか？ ・その成功ロジックは、自社でも再現可能か？
契約範囲の 透明性確認	契約書や提案書における「業務の境界線」や「成果物」の定義を入念に精査する。	・修正回数、定例会の有無、レポートの頻度などが明記されているか？
担当者との 相性確認	契約前の面談に、営業担当者だけでなく実際に運用を担当する「コンサルタント」の同席を求める。	・レスポンスの速さやコミュニケーション頻度は適切か？ ・自社に対する「熱量」や「理解度」は十分に感じられるか？

ステップ➀：自社の「コア業務」と「ノンコア業務」を切り分ける

外部委託の前に、社内業務の棚卸しを行います。「自社でやるべきこと（商品開発、ブランディング、顧客との対話など）」と「プロに任せるべきこと（広告運用、ページ制作、受注処理など）」を明確に区分します。

• 目的： 依頼内容（RFP）を明確にすることで、ミスマッチを防ぎ、無駄なコストを削減するため。

ステップ②：複数の代行会社に問い合わせ、RFP（提案依頼書）を提示する

1社の提案だけで決定せず、必ず3社以上から見積もりと提案を取得します。その際、口頭での依頼ではなく、RFP（提案依頼書）や具体的な要件定義書を提示することが重要です。

• 目的： 同じ条件で各社の「提案力」「戦略眼」「見積もり根拠」を横並びで比較するため。

ステップ③：過去事例の「再現性」があるか実績を確認する

単に「売上〇〇倍の実績」という数字だけを見るのではなく、その成功が「自社でも再現可能か」という視点で確認します。 面談時には、以下のポイントを深く掘り下げてください。

• 類似カテゴリでの実績： 自社と同じ商材ジャンルやターゲット層での成功事例はあるか。
• フェーズの一致： 「立ち上げ期」や「月商1億円突破」など、自社の現在のフェーズと似た状況からの改善実績はあるか。
• 成功の要因： なぜ成功したのか、ロジック（必然性）を持って説明できるか。

ステップ④：契約範囲が明示され、不透明な部分がないか確認する

トラブルの元となるのが「言った・言わない」の問題です。契約書や提案書において、以下の項目が明確に記載されているかを入念にチェックします。

• 業務の境界線： 「制作」に含まれる修正回数は何回か、「コンサルティング」に定例会は含まれるか等。
• 成果物： 毎月どのようなレポートや制作物が納品されるか。
• 目的との整合性： 提案されている業務内容は、自社のKGI（売上目標など）を達成するための手段として適切か。

ステップ⑤：担当者の実績とコミュニケーションの相性を確認する

企業の実績も重要ですが、EC運営の成果は「誰が担当するか（コンサルタントの質）」に大きく依存します。 契約前の面談には、営業担当だけでなく、実際に運用を担当する実務者（コンサルタントやディレクター）に同席を求め、以下の点を確認します。

• 自社のブランドに対する理解と熱量は感じられるか？
• コミュニケーションの頻度やレスポンスの速さは適切か？

ECサイトの運営代行の導入に関するよくある質問（FAQ）

運営代行の契約形態や実務運用に関して、弊社によく寄せられる質問をまとめました。導入検討時の疑問解消にお役立てください。

Q. 契約期間の縛りはありますか？

A. 一般的には6ヶ月〜1年の契約期間が設定されるケースが大半です。
ECサイトの施策（特にSEO対策やコンテンツマーケティング）は、実装してからGoogleなどの検索エンジンに評価され、成果が数値として表れるまでに数ヶ月を要するためです。ただし、キャンペーン対応などスポット（単発）での依頼が可能なプランを用意している企業もあります。

Q. 制作や広告のみなど、部分的な依頼は可能ですか？

A. 可能です。多くの代行会社では、必要な業務のみを切り出したプランを提供しています。
「社内にデザイナーはいるが、マーケターがいない」「受注処理だけ手が回らない」といった場合に、リソースが不足している部分だけを補う使い方が、最も費用対効果を高めるポイントです。

Q. 独自ドメイン（自社サイト）とモール（楽天・Amazon）どちらも対応できますか？

A. 企業によって得意分野が異なります。
「モール運営に特化した企業」や「自社サイのブランディングに強い企業」、あるいは「両対応型」があります。自社が出店しているプラットフォームに強い実績を持つ企業を選定してください。

弊社Proteinumでは、楽天・Amazon・Yahooの3大モールをはじめとして、その他のモールや、自社ECでも構築から運用まで幅広いご支援経験がございます！

まとめ

本記事では、ECサイト運営代行の定義からメリット・デメリット、具体的な選び方までを包括的に解説しました。 市場競争が激化し、業務が高度化する現代のEC事業において、全ての業務を自社リソースだけで完結させることは、もはや現実的ではありません。

運営代行を単なる「作業の外注」と捉えるのではなく、事業成長を加速させるための「戦略的投資」と位置づけ、自社の課題にマッチした最適なパートナーを選定することが成功への近道です。

最後に、本記事の要点をまとめます。

• EC運営代行の本質と役割
  • プロの知見と時間を買い、最短距離で売上最大化を目指すための「投資」である
  • 単なる作業代行ではなく、戦略立案から実務までを担い、売上責任を共有するビジネスパートナーである
• 導入により得られるメリット
  • 自社で専門チームを構築するよりもトータルコストを抑えつつ、「即効性」のある施策が実行できる
  • ノンコア業務を外部化することで、社内リソースを「商品開発」や「ブランディング」などのコア業務に集中できる
  • 客観的なデータ分析により、社内の思い込みを排除した確実性の高い改善が可能になる
• 費用相場と3つの料金体系
  • 固定報酬型（月額10〜50万円目安）： 予算管理が容易で、制作やCSなど特定業務の切り出しに最適
  • 成果報酬型（売上の10〜20%目安）： 初期費用を抑えられるため、リスクを最小化したい立ち上げ期に最適
  • 複合型（固定＋成果）： 安定稼働と売上コミットを両立でき、更なる拡大を目指す成長期に最適
• 失敗しない選び方のポイント
  • 「丸投げ」は避け、RFP（提案依頼書）を用いて自社のコア業務・ノンコア業務を明確に伝える
  • 実績の数だけにとらわれず、自社と同様のフェーズ・商材における「再現性」を確認する
  • 会社の実績だけでなく、実際に担当するコンサルタントとの「相性」や「熱量」を見極める
• 弊社（プロテーナム）について
  • 楽天・Amazon・Yahoo!などのモール型から、自社EC型まで幅広く対応が可能
  • 累計1,000社以上の支援実績と年間10億円の広告運用知見に基づき、貴社のフェーズに合わせた最適なプランをご提案します

「アクセス数はあるのに売上が伸びない」「広告費ばかりかさんで利益が出ない」「何から改善すればいいか分からない」「やりたいことはあるが手が回らず困っている」

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